Menjelang abad ke-20, timbul kesedaran. Tokoh-tokoh seperti (Kelantan), Dol Said (Naning), Mat Salleh (Sabah), Datuk Bahaman (Pahang) menentang British bersenjata. Namun gagal kerana teknologi dan perpecahan.
Srivijaya jatuh, muncul pusat baru: . Kisahnya dramatik. Parameswara (putera raja Srivijaya) melarikan diri dari Temasek (Singapura) selepas diserang Siam. Dalam perburuan di Muar, beliau ke Sening Ujong, lalu ke Bertam. Di sinilah dia melihat seekor pelanduk kecil menendang anjing pemburu. Dia kata, "Tanah ini istimewa." Lalu dinamakannya Melaka (sekitar 1400 M). modul sejarah tingkatan 2 kssm
Perang Saudara di Perak, Selangor, dan Sungai Ujong (Negeri Sembilan) membawa kepada . Ini adalah 'tamparan hebat' kepada kedaulatan Melayu. British melantik Residen yang mesti dirujuk dalam semua urusan kecuali agama Islam dan adat Melayu. Secara perlahan, negeri-negeri ini menjadi Negeri-Negeri Melayu Bersekutu (Perak, Selangor, Negeri Sembilan, Pahang). Manakala yang tidak bersekutu (Johor, Kedah, Perlis, Kelantan, Terengganu) pula akhirnya menerima Penasihat British selepas Perjanjian Bangkok 1909 dengan Siam. Menjelang abad ke-20, timbul kesedaran
British membentuk (Pulau Pinang, Melaka, Singapura) di bawah pentadbiran EIC. Kemudian, campur tangan di negeri-negeri Melayu berpunca daripada perebutan takhta dan perlombongan bijih timah . Srivijaya jatuh, muncul pusat baru: